Bisneto do Grande sábio castelhano, o rabino de Toledo Rabi Isaac Aboab, aluno do Rabino Isaac Campanton. Rabi Isaac Aboab, falecera no Porto, em Portugal, sete meses após a expulsão dos judeus do território espanhol, no inverno de 1493. Sua família tornara-se forçadamente cristãos-novos, e parte de seus descendentes conseguiram chegar à Holanda, retornando à fé judaica reveladamente.

Rabi Isaac A. da Fonseca, seu bisneto, nasceu no ano 1605 em Portugal, e sete anos após chegara sua família a Amsterdam, onde estudou na Iechivá de Rabi Isaac 'Uziel.

No ano 5386 tornou-se o rabino de uma das comunidades de Amsterdam, e 5402 foi convovado pelos judeus de Pernambuco para ocupar ali o cargo, em Recife. Todavia, com a conquista de Pernambuco pelos Holandeses, regressou à Holanda, onde serviu como rabino até seu falecimento, em 27 de adar de 5453 (1693 - cal. gr.).

Escrevera livros em português e em hebraico, e seus discursos em português foram impressos. Traduzira alguns livros do espanhol para o hebraico, as obras de Rabi Abraham Herrera. Deixou após si manuscritos: comentários sobre o tratado talmúdico Qiduchin, e o livro Nichmat Ĥaim, sobre a boa paga e o castigo divino.